Bei bakteriellen Infektionen können so genannte Ubiquitine eine wichtige Rolle spielen. Sind sie ein neuer Ansatz für Therapien?

Worum geht es in diesem Forschungsprojekt?

Schaubild zu Implantat-assoziierten Infektionen

Worum geht es in diesem Forschungsprojekt?

Das Risiko und der Verlauf schwerer bakterieller Infektionen werden insbesondere durch das Wechselspiel zwischen dem spezifischen Bakterium und dem infizierten Menschen determiniert. Auf Seiten des Menschen bestimmen Faktoren wie eine zugrundeliegende Immunschwäche, das Alter und das Vorhandensein von Implantaten das Infektionsrisiko. Bakterielle Infektionserreger nutzen diese Immunschwächen, infizieren den Menschen und lösen Infektionen aus. Gleichzeitig schwächen praktisch alle relevanten bakteriellen Erreger aktiv das Immunsystem des Infizierten und verstärken damit die Infektion. Aufgrund der zunehmenden Resistenz der Bakterien gegenüber Antibiotika stellt die Verhinderung der Schwächung des Immunsystems und seine Stärkung eine innovative therapeutische Option dar.

Wie ist der Stand der Dinge?

Um auf eine Infektion reagieren zu können, verfügt das Immunsystem über ein System aus Rezeptoren, die den Menschen infizierende Bakterien erkennen. Bei Aktivierung dieser Rezeptoren werden in den Immunzellen Abwehrmechanismen ausgelöst, die innerhalb von Minuten antibakterielle Immunreaktionen auslösen. Diese Immunreaktionen sind entscheidend von der postranslationalen Modifikation von Wirtszellproteinen abhängig. Dazu zählt die Ubiquitinierung von Wirtszellproteinen, bei denen entweder Ubiquitinmoleküle an das Protein angelagert oder abgespalten werden. Auch bei länger anhaltenden und chronischen Infektionen ist der Ubiquitinierungsstatus immunologisch wichtiger Signalmoleküle in Immunzellen und auch in infizierten Zellen von grundlegender Bedeutung für den Infektionsverlauf. Aus diesem Grunde haben zahlreiche Bakterien auch Mechanismen entwickelt, um die Ubiquitinierung von Wirtsproteinen zu manipulieren. Eine therapeutische Beeinflussung der Ubiquitinierungsvorgänge ermöglicht potentiell die Behandlung von Infektionen über Antibiotika hinaus.

Das Immunsystem muss sich gegen krankheitserregende Bakterien wehren. Das Foto zeigt eine elektronenmikroskopische Aufnahme des Bakteriums Acinetobacter baumannii. Quelle: Gudrun Holland; Färbung: Michael Laue/RKI

Was sind die Projektziele?

Grundlage für die Entwicklung von Therapeutika, welche die Ubiquitinierung von immunologisch wichtigen Signalmolekülen der Wirtszellen beeinflussen, ist ein vertieftes Verständnis der infektionsimmunologischen Funktion von Ubiquitin anfügenden und abspaltenden Proteasen bei bakteriellen Infektionen. Diese Erkenntnisse ermöglichen die Identifikation besonders wichtiger Ubiquitin-regulierender Wirtszellproteine und bilden die Basis für die gezielte Entwicklung von Therapeutika zur Stärkung der antibakteriellen Immunantwort durch Veränderung der Ubiquitinierung.

Wie kommen wir da hin?

Um das Potential Ubiquitin-modulierender Wirkstoffe als Therapeutika von Infektionen zu evaluieren, werden wir unsere Arbeiten zur funktionellen Bedeutung und der Funktion einzelner Domänen von DUBs weiterführen. Bereits jetzt konnten wir bei den DUBs TNFAIP3, CYLD und OTUB1 entsprechende Untersuchungen durchführen und zeigen, dass bestimmte Domänen dieser DUBs von fundamentaler Bedeutung für die erfolgreiche Kontrolle von bakteriellen Infektionen sind (Just et al., 2016; Wex et al., 2016; Wang et al., 2013; Wang et al., 2019; Nishanth et al., 2013). Zur Durchführung der Struktur-/Funktionsanalysen werden wir auch neue innovative Mausmodelle generieren. Dabei werden wir etablierte experimentelle Infektionsmodelle wie die Listeriose und zusätzliche neue Modelle von infizierten Implantaten verwenden. Ebenso werden wir die Studien auf Ubiquitin-andockende Enzyme wie die E3-Ligase SOCS2 ausweiten. Parallel erfolgt eine Charakterisierung des Expressionsprofils der 100 bekannten DUBs in Proben von humanen Implantat-assoziierten Infektionen (Kooperation mit Prof. Stiesch) sowie bei Patienten mit Cholangitiden (PD Dr. Heidrich). Auf Basis dieser Daten werden wir DUB-Inhibitoren entwickeln, die gegen bestimmte zuvor als relevant identifizierte Domänen von DUBs gerichtet sind, und in den zuvor genannten Modellinfektionen testen.

Elektronen-Mikroskop-Aufnahme von Listeria monocytogenes © Petra Kaiser/RKI

Leitender Forscher des Projekts B12

Projekttitel: Strukturelle und funktionelle Analyse von Deubiquitinasen als Regulatoren und therapeutische Zielstrukturen bei bakteriellen Infektionen

Prof. Dr. Dirk Schlüter

Project: B12

Publikationen des Projektes B12

Publikationen 2024

Cross-regulation of Listeria monocytogenes and the host ubiquitin system in listeriosis. Zhuang, Y., J. B. Fischer, G. Nishanth, and D. Schlüter. 2024.  Eur J Cell Biol 103: 151401.

Publikationen 2023

OTUB1 inhibits breast cancer by non-canonically stabilizing CCN6. Zhao Y, Ruan J, Li Z, Su X, Chen K, Lin Y, Cai Y, Wang P, Liu B, Schlüter D, Liang G, Wang X. Clin Transl Med. 2023 Aug;13(8):e1385.

Publikationen 2022

Ovarian tumor domain proteases in pathogen infection. Schlüter D, Schulze-Niemand E, Stein M, Naumann M.  Trends Microbiol. 2022 Jan;30(1):22-33.

Deubiquitinating enzymes (DUBs): decipher underlying basis of neurodegenerative diseases. Liu B, Ruan J, Chen M, Li Z, Manjengwa G, Schlüter D, Song W, Wang X.  Mol Psychiatry. 2022 Jan;27(1):259-268.

Publikationen 2021

Deubiquitinating enzymes (DUBs): decipher underlying basis of neurodegenerative diseases. Liu B, Ruan J, Chen M, Li Z, Manjengwa G, Schlüter D, Song W, Wang X. Mol Psychiatry. 2021 Jul 20. doi: 10.1038/s41380-021-01233-8. Online ahead of print. PMID: 34285347 Review.

Ovarian tumor domain proteases in pathogen infection. Review. Trends in Microbiology. Dirk Schlüter, EricSchulze-Niemand, Matthias Stein, Michael Naumann, online 17 May 2021 https://doi.org/10.1016/j.tim.2021.04.002

OTUB1 prevents lethal hepatocyte necroptosis through stabilization of c-IAP1 during murine liver inflammation. Koschel J, Nishanth G, Just S, Harit K, Kröger A, Deckert M, Naumann M, Schlüter D. Cell Death Differ. 2021 Mar 12. doi: 10.1038/s41418-021-00752-9. Online ahead of print. PMID: 33712742

Publikationen 2020

Deubiquitinating enzymes (DUBs): DoUBle-edged swords in CNS autoimmunity. J Neuroinflammation. Ruan J, Schlüter D, Wang X. 2020 Apr 6;17(1):102. doi: 10.1186/s12974-020-01783-8. PMID: 32248814; PMCID: PMC7132956.

The deubiquitinase OTUB1 augments NF-κB-dependent immune responses in dendritic cells in infection and inflammation by stabilizing UBC13. Mulas F, Wang X, Song S, Nishanth G, Yi W, Brunn A, Larsen PK, Isermann B, Kalinke U, Barragan A, Naumann M, Deckert M, Schlüter D. . Cell Mol Immunol. 2020 Feb 5. doi: 10.1038/s41423-020-0362-6. Epub ahead of print. PMID: 32024978.

Publikationen 2019

The deubiquitinase OTUB1 inhibits central nervous system autoimmunity by preventing IFN-γ-induced hyperactivation of astrocytes through stabilization of SOCS1 X. Wang, F. Mulas, W Yi, A. Brunn, G. Nishanth, S. Just, A. Waisman, W. Brück, M. Deckert, D. Schlüter (2019) . EMBO J e100947. DOI: 10.15252/embj.2018100947.

Diversity of Bacteria Exhibiting Bile Acid-inducible 7alpha-dehydroxylation Genes in the Human Gut. Vital M, Rud T, Rath S, Pieper DH, Schlüter D. Comput Struct Biotechnol J 2019;17:1016-1019

Publikationen des Projektes B12